Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAD52P43351 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAD52P43351 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD52P43351 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD52P43351 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD52P43351 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD52P43351 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAD52P43351 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAD52P43351 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms