Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CHRNA7P36544 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms