Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCD1P33897 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCD1P33897 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms