Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA3P32297 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHRNA3P32297 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms