Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCKARP32238 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCKARP32238 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKARP32238 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKARP32238 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCKARP32238 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms