Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNGA1P29973 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms