Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMOD1P29536 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms