Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SSFA2P28290 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSFA2P28290 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms