Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTR2AP28223 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms