Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DNMT1P26358 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DNMT1P26358 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms