Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCM3P25205 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCM3P25205 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCM3P25205 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms