Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCP2P22307 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCP2P22307 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCP2P22307 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCP2P22307 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCP2P22307 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms