Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms