Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRAP18433 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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