Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZKSCAN1P17029 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms