Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL3L1P16619 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms