Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPGDP15428 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPGDP15428 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPGDP15428 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms