Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GP1BBP13224 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP1BBP13224 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms