Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH1P12830 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH1P12830 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH1P12830 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDH1P12830 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDH1P12830 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDH1P12830 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDH1P12830 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDH1P12830 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms