Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms