Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms