Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms