Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGA3P0DJD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms