Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RGPD2P0DJD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms