Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB7P09629 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms