Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC1P02654 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC1P02654 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC1P02654 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC1P02654 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms