Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSD2O96028 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSD2O96028 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSD2O96028 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NSD2O96028 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NSD2O96028 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NSD2O96028 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NSD2O96028 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NSD2O96028 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NSD2O96028 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms