Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYF2O95926 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYF2O95926 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYF2O95926 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYF2O95926 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms