Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLDN9O95484 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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CLDN9O95484 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLDN9O95484 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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