Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1O95476 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1O95476 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms