Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPN15O75808 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms