Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITX3O75364 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms