Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NBNO60934 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NBNO60934 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NBNO60934 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NBNO60934 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NBNO60934 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms