Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEMFO60524 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEMFO60524 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEMFO60524 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEMFO60524 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms