Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GATCO43716 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
GATCO43716 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GATCO43716 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GATCO43716 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms