Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXO3O43524 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXO3O43524 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms