Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC4O15439 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC4O15439 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC4O15439 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC4O15439 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms