Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCL9O00512 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCL9O00512 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCL9O00512 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL9O00512 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL9O00512 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL9O00512 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL9O00512 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BCL9O00512 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL9O00512 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL9O00512 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL9O00512 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL9O00512 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL9O00512 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCL9O00512 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BCL9O00512 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms