Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
J3KT08 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
J3KT08 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
J3KT08 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms