Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms