Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms