Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
E9PCH4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
E9PCH4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
E9PCH4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
E9PCH4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
E9PCH4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
E9PCH4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
E9PCH4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
E9PCH4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
E9PCH4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
E9PCH4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms