Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms