Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEURL1BA8MQ27 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms