Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRRM4A7MD48 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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