Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM200CA6NKL6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms