Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC160A6NGH7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms