Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms