Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6CA6NDK9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms