Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms